Институт был создан Постановлением Президиума СО АН СССР от 17 апреля 1973 года № 192 в соответствии с решением Государственного Комитета Совета Министров СССР по науке и технике и Президиума АН СССР на базе крупного Отдела геологии, существовавшего в Бурятском филиале СО АН СССР с 1958 года. Целями и задачами ГИН СО РАН является выяснение общих закономерностей эволюции тектонических структур складчатых поясов, пространственных, временных и генетических связей магматизма и рудообразования с геодинамическими процессами; выявление современных сейсмотектонических, геохимических, биотических и абиотических факторов, определяющих квазистационарное развитие эко- и геосистем Байкальского региона и смежных территорий в позднем кайнозое.

Деятельность организации:
– Образовательная деятельность
– Лаборатория геодинамики
– Лаборатория петрологии
– Лаборатория гидрогеологии и геоэкологии
– Лаборатория геологии кайнозоя
– Лаборатория металлогении и рудообразования
– Лаборатория методов сейсмопрогноза
– Лаборатория геохронологии и геохимии окружающей среды
– Лаборатория инструментальных методов анализа
– Инженерный центр
– Шлифовальная мастерская